便攜水質分析儀應保持清潔干燥，嚴禁溶液流入機內，以免損壞機器，不工作時應切斷電源。
儀器應該遠離強磁場，避免工作時電子顯示跳動，出現不正常現象，因為必須使用卡爾費休試劑和甲醇溶劑，而玻璃滴定管本身因為平衡壓力的關系，又必須與外界接通。
系統全密閉問題。卡爾-費休試劑液路部分連接一定要緊固，從試劑瓶到計量泵再到反應池，否則發生試劑泄漏將直接影響測試結果。其不密閉的另一個問題是測試時由于卡爾費休試劑在試驗中吸收空氣水分，會導致滴定終點延遲。
系統盡量密閉。手動的水分測定儀需要在吸球管路和玻璃滴定管上口加接填充干燥劑的U型管，以便減少空氣水分對測試結果的干擾。在空氣相對濕度大于70%的環境下，應盡量不安排水分測試。
在調整滴定管的滴定速度時，建議調整到1滴/秒，滴定速度太快將導致到達終點時產生的延時誤差較大，而滴定速度太慢則會延長測試的過程，上述干擾容易導致遲遲不到達終點。
取樣的準確問題。在標定卡爾-費休試劑時需要取用10ml，盡量使用10ul取樣器，這樣不但準確、速度快，還能夠防止水滴粘附。同樣地，取用甲醇試劑、乙酯也有類似的問題，取放完畢后應注意盡量縮短反應池打開的時間。
磁性攪拌速度調整。在反應池中，因為滴定試劑加入時在局部，與電極不在一處，因此攪拌速度建議以快到不形成湍流為止，這樣可以盡快達到終點。
在使用儀器前先開機預熱3分鐘，不在強光直射、高溫、高濕或灰塵多的地方存放和使用本儀器；
為避免儀器光路損壞，在搬運過程中應避免儀器強烈碰撞、震動，故在搬運中建議使用儀器原包裝；
為防止光路系統的損壞，不應將溶液溢漏到儀器的比色槽中；
為防止事故及故障的發生，應不擅自拆卸儀器進行維修或更改其內部結構；
儀器配套的試劑應在干燥、密封、避光、低溫條件下保存；
卡爾-費休試劑液路部分連接一定要緊固，從試劑瓶到計量泵再到反應池，否則發生試劑泄漏將直接影響測試結果；
在標定卡爾-費休試劑時需要取用10毫克水，盡量使用10ul取樣器，這樣不但準確、速度快，還能夠防止水滴粘附。同樣地，取用甲醇試劑、乙酯也有類似的問題，取放完畢后應注意盡量縮短反應池打開的時間；
在反應池中，因為滴定試劑加入時在局部，與電極不在一處，因此攪拌速度好以快到不形成湍流為止，這樣可以快達到終點；
滴定時先快速以盡量縮短試驗時間，而在接近終點時應變慢，這樣可提高計量準確度。
當日試驗完畢后，一定要排空系統中的卡爾-費休試劑，然后用甲醇清洗干凈，千萬不能用水清洗系統，因為其不容易揮發，將造成下次試驗時卡爾-費休試劑標定不實；
便攜水質分析儀應該遠離強磁場，避免工作時電子顯示跳動，出現不正常現象；
操作過程中，實驗人員應做好個人防護(實驗服、手套、口罩)，特別是使用硫酸、鹽酸、氨水等強腐蝕性液體時要注意個人安全。
